MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus CN1 plasmid

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022227	A	6	6	76	81	100 %	0 %	0 %	0 %	537462572
2	NC_022227	AT	3	6	124	129	50 %	50 %	0 %	0 %	537462572
3	NC_022227	A	6	6	259	264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022227	CTA	2	6	266	271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022227	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022227	TAG	2	6	281	286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022227	GTA	2	6	300	305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022227	A	6	6	353	358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022227	CGA	2	6	360	365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022227	ACG	2	6	440	445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_022227	TTAT	2	8	519	526	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022227	TAA	2	6	556	561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022227	GAA	2	6	682	687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022227	ATT	2	6	817	822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022227	TAT	2	6	870	875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537462573
16	NC_022227	GTT	2	6	886	891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537462573
17	NC_022227	GCT	3	9	892	900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537462573
18	NC_022227	CAG	2	6	917	922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537462573
19	NC_022227	TTA	2	6	928	933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537462573
20	NC_022227	TTA	2	6	940	945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537462573
21	NC_022227	T	6	6	949	954	0 %	100 %	0 %	0 %	537462573
22	NC_022227	TAT	2	6	1014	1019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537462573
23	NC_022227	TTAG	2	8	1027	1034	25 %	50 %	25 %	0 %	537462573
24	NC_022227	ATG	2	6	1133	1138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537462573
25	NC_022227	AG	3	6	1154	1159	50 %	0 %	50 %	0 %	537462573
26	NC_022227	A	6	6	1162	1167	100 %	0 %	0 %	0 %	537462573
27	NC_022227	TGAA	2	8	1172	1179	50 %	25 %	25 %	0 %	537462573
28	NC_022227	ATA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537462573
29	NC_022227	TTAC	2	8	1294	1301	25 %	50 %	0 %	25 %	537462573
30	NC_022227	TAATTT	2	12	1316	1327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537462573
31	NC_022227	TCT	2	6	1328	1333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537462573
32	NC_022227	TTG	2	6	1382	1387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537462573
33	NC_022227	TA	3	6	1420	1425	50 %	50 %	0 %	0 %	537462573
34	NC_022227	TTTA	2	8	1434	1441	25 %	75 %	0 %	0 %	537462573
35	NC_022227	TTA	3	9	1439	1447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537462573
36	NC_022227	TGTGA	2	10	1528	1537	20 %	40 %	40 %	0 %	537462574
37	NC_022227	T	6	6	1575	1580	0 %	100 %	0 %	0 %	537462574
38	NC_022227	AGA	2	6	1581	1586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537462574
39	NC_022227	A	6	6	1619	1624	100 %	0 %	0 %	0 %	537462574
40	NC_022227	TGA	2	6	1629	1634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537462574
41	NC_022227	GAA	2	6	1635	1640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537462574
42	NC_022227	AGA	2	6	1668	1673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537462574
43	NC_022227	TG	3	6	1679	1684	0 %	50 %	50 %	0 %	537462574
44	NC_022227	CAT	2	6	1732	1737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537462574
45	NC_022227	TA	3	6	1748	1753	50 %	50 %	0 %	0 %	537462574
46	NC_022227	ATT	2	6	1796	1801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537462574
47	NC_022227	TTA	2	6	1802	1807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537462574
48	NC_022227	AG	3	6	1822	1827	50 %	0 %	50 %	0 %	537462574
49	NC_022227	TCT	2	6	1875	1880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022227	TA	3	6	1892	1897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022227	TA	4	8	1913	1920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022227	A	6	6	1987	1992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022227	TAT	2	6	2002	2007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022227	ATA	2	6	2026	2031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022227	ATA	2	6	2055	2060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537462575
56	NC_022227	CTA	2	6	2061	2066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537462575
57	NC_022227	ATA	2	6	2088	2093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537462575
58	NC_022227	AAC	2	6	2124	2129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537462575
59	NC_022227	GA	3	6	2137	2142	50 %	0 %	50 %	0 %	537462575
60	NC_022227	TGA	2	6	2248	2253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537462575
61	NC_022227	GAA	2	6	2360	2365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537462575
62	NC_022227	GTTG	2	8	2391	2398	0 %	50 %	50 %	0 %	537462575
63	NC_022227	CAA	2	6	2412	2417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537462575
64	NC_022227	A	6	6	2416	2421	100 %	0 %	0 %	0 %	537462575
65	NC_022227	CTAA	2	8	2462	2469	50 %	25 %	0 %	25 %	537462575
66	NC_022227	TTG	2	6	2514	2519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537462575
67	NC_022227	TAA	2	6	2548	2553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537462575
68	NC_022227	A	7	7	2617	2623	100 %	0 %	0 %	0 %	537462575
69	NC_022227	TA	3	6	2630	2635	50 %	50 %	0 %	0 %	537462575
70	NC_022227	AAG	2	6	2640	2645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537462575
71	NC_022227	A	6	6	2723	2728	100 %	0 %	0 %	0 %	537462575
72	NC_022227	ATC	2	6	2782	2787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537462575
73	NC_022227	T	6	6	2791	2796	0 %	100 %	0 %	0 %	537462575
74	NC_022227	TGA	4	12	2800	2811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537462575
75	NC_022227	A	7	7	2811	2817	100 %	0 %	0 %	0 %	537462575
76	NC_022227	TGG	2	6	2875	2880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537462575
77	NC_022227	TGA	2	6	2950	2955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537462575
78	NC_022227	ACA	2	6	2963	2968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537462575
79	NC_022227	GAA	3	9	2972	2980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537462575
80	NC_022227	ATT	3	9	3024	3032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537462575
81	NC_022227	T	7	7	3058	3064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022227	T	6	6	3070	3075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022227	A	6	6	3078	3083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022227	TGTA	2	8	3111	3118	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022227	AT	3	6	3144	3149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022227	CGA	2	6	3202	3207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.